MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Mycobacterium yongonense 05-1390 plasmid pMyong1

Total Repeats: 3160

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020275	TGG	2	6	4	9	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020275	GCC	2	6	159	164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_020275	CTTA	2	8	184	191	25 %	50 %	0 %	25 %	451770452
4	NC_020275	GCA	2	6	244	249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451770452
5	NC_020275	ATC	2	6	339	344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_020275	TGC	2	6	360	365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_020275	CTC	2	6	403	408	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_020275	GGA	2	6	414	419	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020275	CCCACG	2	12	492	503	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	451770453
10	NC_020275	TGT	2	6	597	602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451770453
11	NC_020275	GTT	2	6	704	709	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451770453
12	NC_020275	CAA	2	6	711	716	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451770453
13	NC_020275	CGAC	2	8	726	733	25 %	0 %	25 %	50 %	451770453
14	NC_020275	ACG	2	6	761	766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451770453
15	NC_020275	TAC	2	6	767	772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451770453
16	NC_020275	CG	3	6	787	792	0 %	0 %	50 %	50 %	451770453
17	NC_020275	GC	3	6	869	874	0 %	0 %	50 %	50 %	451770453
18	NC_020275	CGA	2	6	925	930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451770453
19	NC_020275	GAA	2	6	946	951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451770453
20	NC_020275	CGA	2	6	970	975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451770453
21	NC_020275	CTG	2	6	980	985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451770453
22	NC_020275	GGCG	3	12	994	1005	0 %	0 %	75 %	25 %	451770453
23	NC_020275	CG	3	6	1131	1136	0 %	0 %	50 %	50 %	451770453
24	NC_020275	CAT	2	6	1195	1200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451770453
25	NC_020275	GCC	2	6	1235	1240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451770453
26	NC_020275	GA	3	6	1296	1301	50 %	0 %	50 %	0 %	451770453
27	NC_020275	GGTC	2	8	1357	1364	0 %	25 %	50 %	25 %	451770453
28	NC_020275	TC	3	6	1396	1401	0 %	50 %	0 %	50 %	451770453
29	NC_020275	GGC	2	6	1496	1501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451770453
30	NC_020275	TCA	2	6	1635	1640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451770453
31	NC_020275	ACG	2	6	1668	1673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451770453
32	NC_020275	GGT	2	6	1687	1692	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451770453
33	NC_020275	TGC	2	6	1698	1703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451770453
34	NC_020275	GCC	2	6	1767	1772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451770453
35	NC_020275	GCT	2	6	1854	1859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451770454
36	NC_020275	TTG	2	6	1879	1884	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451770454
37	NC_020275	AGG	2	6	1889	1894	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	451770454
38	NC_020275	GCG	2	6	1916	1921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451770454
39	NC_020275	CCG	2	6	1984	1989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451770454
40	NC_020275	CTG	2	6	2029	2034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451770454
41	NC_020275	CGCC	2	8	2096	2103	0 %	0 %	25 %	75 %	451770454
42	NC_020275	GCC	2	6	2114	2119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451770454
43	NC_020275	CGG	3	9	2132	2140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451770454
44	NC_020275	GCA	2	6	2193	2198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451770454
45	NC_020275	CTG	2	6	2236	2241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451770454
46	NC_020275	GCG	2	6	2255	2260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451770454
47	NC_020275	GCC	2	6	2335	2340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451770454
48	NC_020275	CAC	2	6	2380	2385	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451770454
49	NC_020275	GCG	2	6	2492	2497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451770454
50	NC_020275	GC	3	6	2534	2539	0 %	0 %	50 %	50 %	451770454
51	NC_020275	ACCC	2	8	2551	2558	25 %	0 %	0 %	75 %	451770454
52	NC_020275	TCG	2	6	2576	2581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451770454
53	NC_020275	CGC	2	6	2583	2588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451770454
54	NC_020275	GC	3	6	2592	2597	0 %	0 %	50 %	50 %	451770454
55	NC_020275	CAC	3	9	2614	2622	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451770454
56	NC_020275	GGT	2	6	2628	2633	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451770454
57	NC_020275	GCC	2	6	2644	2649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451770454
58	NC_020275	CTG	2	6	2743	2748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451770454
59	NC_020275	TCC	2	6	2765	2770	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	451770454
60	NC_020275	GATC	2	8	2784	2791	25 %	25 %	25 %	25 %	451770454
61	NC_020275	GAC	2	6	2879	2884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451770455
62	NC_020275	CGG	2	6	2987	2992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451770455
63	NC_020275	CCA	2	6	2998	3003	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451770455
64	NC_020275	GC	3	6	3020	3025	0 %	0 %	50 %	50 %	451770455
65	NC_020275	CCA	2	6	3085	3090	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451770455
66	NC_020275	TGG	2	6	3237	3242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451770455
67	NC_020275	AAC	2	6	3264	3269	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451770455
68	NC_020275	CTGGA	2	10	3279	3288	20 %	20 %	40 %	20 %	451770455
69	NC_020275	GCG	2	6	3352	3357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451770455
70	NC_020275	CTG	2	6	3372	3377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451770455
71	NC_020275	AGT	2	6	3389	3394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451770455
72	NC_020275	GCA	2	6	3410	3415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451770455
73	NC_020275	GATC	2	8	3418	3425	25 %	25 %	25 %	25 %	451770455
74	NC_020275	CGAC	2	8	3442	3449	25 %	0 %	25 %	50 %	451770455
75	NC_020275	ACG	2	6	3469	3474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451770455
76	NC_020275	ACG	2	6	3526	3531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451770455
77	NC_020275	GC	3	6	3539	3544	0 %	0 %	50 %	50 %	451770455
78	NC_020275	CAT	2	6	3572	3577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451770455
79	NC_020275	CTT	2	6	3584	3589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451770455
80	NC_020275	CGC	2	6	3677	3682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451770455
81	NC_020275	GC	3	6	3681	3686	0 %	0 %	50 %	50 %	451770455
82	NC_020275	GCCC	2	8	3705	3712	0 %	0 %	25 %	75 %	451770455
83	NC_020275	CGT	2	6	3755	3760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451770455
84	NC_020275	GC	3	6	3761	3766	0 %	0 %	50 %	50 %	451770455
85	NC_020275	CGC	3	9	3803	3811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451770455
86	NC_020275	CGC	2	6	3818	3823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451770455
87	NC_020275	CCG	2	6	3865	3870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451770455
88	NC_020275	CA	3	6	3977	3982	50 %	0 %	0 %	50 %	451770455
89	NC_020275	GCTC	2	8	4140	4147	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
90	NC_020275	CAG	2	6	4297	4302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451770456
91	NC_020275	CCGG	2	8	4310	4317	0 %	0 %	50 %	50 %	451770456
92	NC_020275	CCGA	2	8	4402	4409	25 %	0 %	25 %	50 %	451770456
93	NC_020275	CGG	3	9	4421	4429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451770456
94	NC_020275	ACCGC	2	10	4536	4545	20 %	0 %	20 %	60 %	451770456
95	NC_020275	AGT	2	6	4656	4661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451770456
96	NC_020275	GCGCC	2	10	4743	4752	0 %	0 %	40 %	60 %	451770456
97	NC_020275	ACC	2	6	4799	4804	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451770456
98	NC_020275	AGC	2	6	4805	4810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451770456
99	NC_020275	CGA	2	6	4893	4898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451770456
100	NC_020275	GTC	2	6	5011	5016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451770456
101	NC_020275	CGG	2	6	5094	5099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451770456
102	NC_020275	TTGGTC	2	12	5189	5200	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	451770456
103	NC_020275	AAC	2	6	5213	5218	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451770456
104	NC_020275	CGG	2	6	5235	5240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451770456
105	NC_020275	CGG	2	6	5277	5282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451770456
106	NC_020275	CTGC	2	8	5339	5346	0 %	25 %	25 %	50 %	451770456
107	NC_020275	CGC	2	6	5463	5468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451770456
108	NC_020275	TCA	2	6	5480	5485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451770456
109	NC_020275	CTGC	2	8	5490	5497	0 %	25 %	25 %	50 %	451770456
110	NC_020275	TTCC	2	8	5539	5546	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_020275	GTC	2	6	5689	5694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451770457
112	NC_020275	AAT	2	6	5744	5749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020275	GC	3	6	5804	5809	0 %	0 %	50 %	50 %	451770458
114	NC_020275	CGCTGC	2	12	5816	5827	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	451770458
115	NC_020275	TTC	2	6	5830	5835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451770458
116	NC_020275	CGG	2	6	5859	5864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451770458
117	NC_020275	CCTGG	2	10	5907	5916	0 %	20 %	40 %	40 %	451770458
118	NC_020275	GGT	2	6	5951	5956	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_020275	GT	3	6	5980	5985	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_020275	GAT	2	6	6025	6030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020275	CGA	2	6	6059	6064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451770459
122	NC_020275	CGA	2	6	6109	6114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451770459
123	NC_020275	GTG	2	6	6164	6169	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451770459
124	NC_020275	CCG	2	6	6197	6202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451770459
125	NC_020275	CGG	2	6	6211	6216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451770459
126	NC_020275	GCGG	2	8	6266	6273	0 %	0 %	75 %	25 %	451770459
127	NC_020275	GCGG	2	8	6287	6294	0 %	0 %	75 %	25 %	451770459
128	NC_020275	CGG	2	6	6334	6339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451770459
129	NC_020275	TCG	2	6	6384	6389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451770460
130	NC_020275	ACC	2	6	6393	6398	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451770460
131	NC_020275	CG	3	6	6442	6447	0 %	0 %	50 %	50 %	451770460
132	NC_020275	GTC	2	6	6448	6453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451770460
133	NC_020275	CG	3	6	6530	6535	0 %	0 %	50 %	50 %	451770460
134	NC_020275	ACG	2	6	6540	6545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451770460
135	NC_020275	ACG	2	6	6588	6593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451770460
136	NC_020275	GCA	2	6	6645	6650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451770460
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138	NC_020275	ACC	2	6	6689	6694	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451770460
139	NC_020275	GCCA	2	8	6707	6714	25 %	0 %	25 %	50 %	451770460
140	NC_020275	CGG	2	6	6887	6892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451770461
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145	NC_020275	GTG	2	6	6990	6995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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162	NC_020275	CGA	2	6	7629	7634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451770462
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263	NC_020275	CGA	2	6	11226	11231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451770467
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266	NC_020275	CG	3	6	11429	11434	0 %	0 %	50 %	50 %	451770467
267	NC_020275	CGC	2	6	11440	11445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451770467
268	NC_020275	TCGGCA	2	12	11455	11466	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	451770467
269	NC_020275	GCC	2	6	11467	11472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451770467
270	NC_020275	CGC	2	6	11478	11483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451770467
271	NC_020275	CGA	2	6	11505	11510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451770467
272	NC_020275	TCC	2	6	11557	11562	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	451770467
273	NC_020275	CAA	2	6	11572	11577	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451770467
274	NC_020275	GAC	2	6	11578	11583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451770467
275	NC_020275	CACCGT	2	12	11589	11600	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	451770467
276	NC_020275	CAA	2	6	11616	11621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451770467
277	NC_020275	GAC	2	6	11623	11628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451770467
278	NC_020275	TGA	2	6	11672	11677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451770467
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280	NC_020275	CGG	2	6	11694	11699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451770467
281	NC_020275	ACC	2	6	11710	11715	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451770467
282	NC_020275	GGT	2	6	11743	11748	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451770467
283	NC_020275	TAGC	2	8	11773	11780	25 %	25 %	25 %	25 %	451770468
284	NC_020275	CCA	2	6	11803	11808	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451770468
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290	NC_020275	TGA	2	6	11976	11981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451770468
291	NC_020275	TTC	2	6	12037	12042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451770468
292	NC_020275	TGT	2	6	12066	12071	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451770468
293	NC_020275	GAT	2	6	12094	12099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451770468
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297	NC_020275	AGC	2	6	12236	12241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451770468
298	NC_020275	CGA	2	6	12258	12263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451770468
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300	NC_020275	CGG	2	6	12330	12335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451770468
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303	NC_020275	GAT	2	6	12403	12408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451770468
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307	NC_020275	GTAG	2	8	12546	12553	25 %	25 %	50 %	0 %	451770468
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312	NC_020275	CGG	2	6	12722	12727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451770468
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323	NC_020275	GGC	2	6	13393	13398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451770468
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332	NC_020275	CGA	2	6	13764	13769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451770468
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336	NC_020275	GCG	2	6	13930	13935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451770468
337	NC_020275	GCA	2	6	14103	14108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451770468
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339	NC_020275	CAG	2	6	14137	14142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451770468
340	NC_020275	CAG	3	9	14179	14187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451770468
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343	NC_020275	CGG	2	6	14227	14232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451770468
344	NC_020275	CGG	2	6	14310	14315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451770468
345	NC_020275	CAG	2	6	14407	14412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451770468
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347	NC_020275	CGG	2	6	14499	14504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451770468
348	NC_020275	CGA	2	6	14517	14522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451770468
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351	NC_020275	CAC	2	6	14626	14631	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451770468
352	NC_020275	CAG	2	6	14659	14664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451770468
353	NC_020275	CCAC	2	8	14676	14683	25 %	0 %	0 %	75 %	451770468
354	NC_020275	GCC	2	6	14729	14734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451770468
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356	NC_020275	GCG	2	6	14762	14767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451770468
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358	NC_020275	CGCTA	2	10	14871	14880	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
359	NC_020275	AAG	2	6	14901	14906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
360	NC_020275	GGC	3	9	14918	14926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451770469
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363	NC_020275	AC	3	6	15293	15298	50 %	0 %	0 %	50 %	451770469
364	NC_020275	CAT	2	6	15317	15322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451770469
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370	NC_020275	CGA	2	6	15481	15486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451770469
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372	NC_020275	TAC	2	6	15583	15588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451770469
373	NC_020275	CGA	2	6	15593	15598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451770469
374	NC_020275	ACC	2	6	15655	15660	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451770469
375	NC_020275	GCCG	2	8	15665	15672	0 %	0 %	50 %	50 %	451770469
376	NC_020275	TCG	2	6	15737	15742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
377	NC_020275	GTT	2	6	15830	15835	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451770470
378	NC_020275	GTC	2	6	15869	15874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451770470
379	NC_020275	CGC	2	6	15897	15902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451770470
380	NC_020275	GGC	2	6	15953	15958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451770470
381	NC_020275	CCG	2	6	15960	15965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451770470
382	NC_020275	TGG	2	6	16117	16122	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451770470
383	NC_020275	CAG	2	6	16146	16151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451770470
384	NC_020275	GCTGAT	2	12	16226	16237	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	451770470
385	NC_020275	CGA	2	6	16244	16249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451770470
386	NC_020275	CAT	2	6	16268	16273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451770470
387	NC_020275	CCCGGC	2	12	16288	16299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451770470
388	NC_020275	CG	3	6	16327	16332	0 %	0 %	50 %	50 %	451770470
389	NC_020275	GCT	2	6	16385	16390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451770470
390	NC_020275	GAA	2	6	16391	16396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451770470
391	NC_020275	GGGC	2	8	16430	16437	0 %	0 %	75 %	25 %	451770470
392	NC_020275	CG	3	6	16488	16493	0 %	0 %	50 %	50 %	451770470
393	NC_020275	GCC	2	6	16552	16557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451770470
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499	NC_020275	TG	3	6	21326	21331	0 %	50 %	50 %	0 %	451770475
500	NC_020275	GAA	2	6	21349	21354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451770475

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